Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN4O43707 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms