Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms