Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBDO15205 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBDO15205 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBDO15205 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBDO15205 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBDO15205 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBDO15205 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBDO15205 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBDO15205 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBDO15205 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBDO15205 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBDO15205 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBDO15205 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBDO15205 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBDO15205 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBDO15205 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBDO15205 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBDO15205 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBDO15205 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms