Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBTB39O15060 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBTB39O15060 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms