Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASKO14936 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASKO14936 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASKO14936 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASKO14936 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms