Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IKBKBO14920 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms