Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOC4-APOC2K7ER74 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOC4-APOC2K7ER74 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms