Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB9F8W1W9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms