Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCRIP1C9JLW8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms