Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DEV8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DEV8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DEV8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4DEV8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4DEV8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms