Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3BA8MYP8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms