Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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