Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms