Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L4A6NCW7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms