Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms