Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC66A2RUB6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC66A2RUB6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms