Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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