Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDGFDQ9GZP0 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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