Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AL929601.3-201ENST00000613990 2086 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL139020.1-203ENST00000556386 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 USP32P1-201ENST00000341745 3233 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 SLC17A6-201ENST00000263160 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC00467-201ENST00000423222 3508 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC02239-201ENST00000504339 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 GLRX3P2-201ENST00000405027 1038 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 HMGN1P34-201ENST00000413023 290 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 HSPD1P18-201ENST00000504252 244 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC100849.1-202ENST00000517949 562 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 OPRK1-204ENST00000524278 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC090692.1-201ENST00000531569 541 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC006065.2-201ENST00000536978 211 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 BLOC1S6-218ENST00000568816 4013 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 RBFOX1-223ENST00000620507 4018 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ATP8A2-201ENST00000255283 3287 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC012467.2-201ENST00000607783 2583 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC008758.1-201ENST00000428311 4505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MAGEE2-201ENST00000373359 2249 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 MUC20-204ENST00000445522 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 AL008638.2-201ENST00000453934 2383 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
HLA-CQ95604 NOS2-202ENST00000621962 3345 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms