Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SDK2Q58EX2 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms