Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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GAPVD1Q14C86 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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GAPVD1Q14C86 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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GAPVD1Q14C86 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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GAPVD1Q14C86 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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GAPVD1Q14C86 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
GAPVD1Q14C86 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
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