Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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