Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RTCA-AS1-201ENST00000421185 423 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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