Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NBPF12-207ENST00000617864 2051 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NDUFB3-201ENST00000237889 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR370-201ENST00000362135 75 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU1-120P-201ENST00000363009 157 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SPP2-202ENST00000373368 860 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MAS1L-201ENST00000377127 1260 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RFPL3-202ENST00000397468 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC013248.2-201ENST00000412454 459 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 STPG3-202ENST00000412566 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SRP68P3-201ENST00000416871 344 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AKR1B1P4-201ENST00000426552 922 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC073346.1-202ENST00000430610 544 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL513122.2-201ENST00000437135 838 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR4435-2HG-208ENST00000439494 707 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 C11orf94-201ENST00000449465 369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HCG25-220ENST00000450514 759 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TMEM213-204ENST00000458494 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC008667.3-201ENST00000506892 553 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC015909.1-201ENST00000509943 839 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC022784.6-205ENST00000518619 807 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP003049.2-201ENST00000532992 540 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01579-201ENST00000553818 561 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FRG2KP-202ENST00000568403 827 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC116914.1-201ENST00000575043 398 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC015909.4-201ENST00000577175 578 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC012572.1-201ENST00000581634 397 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ORMDL3-208ENST00000584220 414 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TEX26-AS1-217ENST00000593246 797 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P37-201ENST00000604107 901 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PLS3-AS1-201ENST00000606397 521 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ASNSD1-207ENST00000607535 579 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms