Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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