Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL390866.1-201ENST00000425137 469 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 Z99943.2-201ENST00000507585 266 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AP006437.1-202ENST00000530327 933 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PDE4DIP-241ENST00000616206 874 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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