Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC037198.1-201ENST00000560769 281 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SGK1-201ENST00000237305 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CEACAM8-201ENST00000244336 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 NKAIN2-202ENST00000368417 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MAPK10-301ENST00000641313 2482 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PARP11-204ENST00000447133 4377 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ATP7B-215ENST00000634844 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL353132.1-201ENST00000415260 2043 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SORCS1-203ENST00000369698 2638 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LINC00607-205ENST00000445174 3690 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TUBA1A-202ENST00000301071 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SYTL4-202ENST00000276141 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 DCLRE1B-201ENST00000369563 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 HEPACAM2-204ENST00000453812 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 FAM74A4-203ENST00000621724 1862 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 USP17L21-202ENST00000621388 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 NDUFB5-214ENST00000493866 4046 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 OR1X1P-201ENST00000606159 931 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 AC007638.2-201ENST00000574716 1740 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 DSG4-201ENST00000308128 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PFKM-203ENST00000359794 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC021054.1-201ENST00000537514 2338 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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