Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CENPFP49454 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CENPFP49454 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CENPFP49454 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CENPFP49454 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CENPFP49454 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms