Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms