Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CAVIN4Q5BKX8 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms