Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms