Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
GAPVD1Q14C86 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms