Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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