Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CXCR4-201ENST00000241393 1682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC073065.1-201ENST00000411678 2866 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms