Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.3 ms