Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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