Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC009163.7-201ENST00000621929 2557 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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