Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms