Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC093616.1-201ENST00000427434 2095 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
NEDD1Q8NHV4 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEDD1Q8NHV4 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms