Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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BRD3Q15059 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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BRD3Q15059 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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