Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CHD4Q14839 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms