Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 DNMBP-204ENST00000636706 5437 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PDE6A-201ENST00000255266 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OPCML-201ENST00000331898 6833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms