Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TMPOP42166 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMPOP42166 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMPOP42166 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMPOP42166 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMPOP42166 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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