Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LTBRP36941 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LTBRP36941 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms