Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms