Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CST11-201ENST00000377007 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P34-201ENST00000413023 290 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPL3P4-201ENST00000417615 423 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HCG21-204ENST00000419481 605 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC114760.1-201ENST00000420310 652 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL031733.1-201ENST00000422817 455 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS6P3-201ENST00000456660 1107 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL757P-201ENST00000466709 301 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPL17P37-201ENST00000490729 548 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01948-201ENST00000506836 656 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P10-201ENST00000508631 558 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NACA2-201ENST00000521764 777 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132D-AS1-206ENST00000541320 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ACTN1-AS1-201ENST00000553944 484 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL121917.2-201ENST00000605044 390 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNF219-AS1-213ENST00000607860 577 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.29-201ENST00000616220 280 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CSTL1-205ENST00000619238 477 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CU634019.6-201ENST00000623165 710 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC093495.1-212ENST00000630173 1162 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 FRG2-201ENST00000378763 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 WASF4P-201ENST00000444248 1494 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN16-201ENST00000340487 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00955-202ENST00000514422 1502 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NSD1-216ENST00000638627 1866 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P10-201ENST00000475365 1390 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT4-216ENST00000580844 1396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ASB15-205ENST00000451215 2956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 GOSR2-232ENST00000640051 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AHCYP5-201ENST00000331585 1238 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms