Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CRIP1P4-201ENST00000442565 229 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC01696-201ENST00000448988 492 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PGA5-202ENST00000451616 971 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 NBPF2P-201ENST00000453025 661 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RN7SL420P-201ENST00000463843 298 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL451124.1-201ENST00000478520 1026 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 IGLVI-56-201ENST00000521342 342 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC116456.1-202ENST00000528151 597 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC103681.1-201ENST00000531663 423 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PGA3-207ENST00000543125 968 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC007785.1-201ENST00000597989 332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ST7-OT3_2.1-201ENST00000617884 137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SYN3-213ENST00000619146 561 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC091962.1-201ENST00000561496 1765 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL590426.1-201ENST00000440811 2285 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CDH23-213ENST00000619887 4224 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 THBS3-203ENST00000457183 2727 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC01140-201ENST00000461990 3181 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SPIN3-205ENST00000638289 4614 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MRPS11-201ENST00000325844 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SATB1-204ENST00000417717 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PRCP-202ENST00000393399 2120 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MOV10L1-209ENST00000540615 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 WDR20-206ENST00000454394 2067 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SMIM8-201ENST00000229570 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SLC11A2-212ENST00000547688 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ZSCAN26-202ENST00000421553 2835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SEZ6L2-201ENST00000308713 3801 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 FAM107B-206ENST00000378470 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 NMT1-201ENST00000258960 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TRIM16-201ENST00000336708 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 GAPDHP72-201ENST00000402643 1010 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 AC092580.2-201ENST00000414654 469 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LENG8-AS1-202ENST00000429922 871 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 AL591806.1-201ENST00000447167 1109 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL683842.1-201ENST00000455505 525 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RPPH1-3P-201ENST00000516541 322 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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