Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC005099.1-201ENST00000442083 610 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL391361.2-202ENST00000454826 439 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC124861.1-201ENST00000457178 429 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC020687.1-201ENST00000560439 448 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CGA-202ENST00000610310 615 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HSD11B1-202ENST00000367027 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NIM1K-204ENST00000512796 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL022323.2-201ENST00000623239 3000 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CCRL2-204ENST00000400882 1642 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CAB39-207ENST00000614925 1619 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 GOSR2-232ENST00000640051 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC000036.1-201ENST00000449652 2030 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MAPK10-232ENST00000515400 2076 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC008985.1-201ENST00000624169 2239 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HIST1H4F-201ENST00000244537 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CCNYL3-201ENST00000407030 998 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC006017.1-201ENST00000424630 673 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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