Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BNIP1Q12981 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms