Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
AP1B1Q10567 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms